近日,上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院、微生物代謝國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室在DNA磷硫?;揎椃矫嫒〉猛黄?,《Nature Communications》在線發(fā)表了由德林教授研究小組的最新進(jìn)展《Genomic mapping of phosphorothioates reveals partial modification of short consensus sequences》。
DNA磷硫?;揎棌V泛存在于細(xì)菌中,與細(xì)菌的自我防衛(wèi)機(jī)制緊密相關(guān),然而其序列特異性及在細(xì)菌基因組中的分布情況尚無報(bào)道。本工作以大腸桿菌Escherichia coliB7A為研究對(duì)象,建立了單分子實(shí)時(shí)測(cè)序(single molecule real-time sequencing,SMRT)和碘切割依賴的深度測(cè)序(deep sequencing of iodine-induced cleavage at PT,ICDS)兩種新穎的技術(shù),測(cè)定了基因組水平DNA磷硫?;揎椢稽c(diǎn),首次獲得了精確的細(xì)菌基因組磷硫?;揎椢稽c(diǎn)分布圖譜。
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