近日,從上海交通大學獲悉,該校微生物代謝國家重點實驗室由德林研究小組在DNA磷硫酰化修飾方面取得突破。相關成果在線發(fā)表于《自然—通訊》雜志。
DNA是生命的遺傳物質(zhì),由碳、氫、氧、氮、磷五種元素組成。中科院院士鄧子新領銜的團隊在前期工作中發(fā)現(xiàn)了DNA上存在一種全新的修飾——磷硫酰化修飾。這一現(xiàn)象被國際同行公認為“迄今為止在DNA骨架上發(fā)現(xiàn)的第一個天然修飾”,也是目前在DNA骨架上發(fā)現(xiàn)的第六種元素。
由德林團隊以大腸桿菌Escherichia coli B7A為研究對象,建立了單分子實時測序和碘切割依賴的深度測序等兩種前沿技術(shù),測定了基因組水平DNA磷硫?;揎椢稽c,首次獲得了精確的細菌基因組磷硫?;揎椢稽c分布圖譜。
據(jù)了解,這兩種測序方法相互補充,測得修飾位點具有保守的GpsAAC/GpsTTC短序列特征。而大腸桿菌中同樣存在一個DNA磷硫酰化修飾—限制系統(tǒng),并且其基因組中只有部分GAAC/GTTC位點被DNA磷硫?;揎椕缸R別修飾。該發(fā)現(xiàn)表明,DNA磷硫?;揎棥拗葡到y(tǒng)不同于經(jīng)典的甲基化修飾—限制系統(tǒng),具有特殊的作用機制。