RPA就是RNA酶保護(hù)分析，是以液相雜交為基礎(chǔ)發(fā)展起來的，可用于基因和mRNA的結(jié)構(gòu)分析以及mRNA的定量研究。其原理是在體外經(jīng)轉(zhuǎn)錄合成一個(gè)帶有標(biāo)記的單鏈RNA探針，此探針與待測(cè)RNA在序列上互補(bǔ)，二者雜交后，用RNA酶處理，未形成雙鏈的RNA單鏈被水解成單核苷酸，雜交形成的雙鏈RNA受到保護(hù)，不被降解，然后通過電泳進(jìn)行RNA-RNA雜交體的檢測(cè)。RPA的檢測(cè)方法十分靈敏，結(jié)果可靠，是分析mRNA定量、mRNA末端定位以及確定內(nèi)含子位置的常用方法。
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