今年華大與美國(guó)大學(xué)合作的關(guān)于北極熊的基因組分析有什么意義?

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wsj3014
wsj3014 2021-11-19 11:37
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  • 2021-11-19 12:14

    北極熊基因編碼為心血管疾病提供思路,通過(guò)對(duì)基因組中編碼蛋白的相關(guān)基因進(jìn)行更深入的分析后,研究人員發(fā)現(xiàn)很多與脂肪酸代謝和心血管功能相關(guān)的基因在北極熊中已經(jīng)發(fā)生了適應(yīng)性的進(jìn)化,這可能是它之所以能夠適應(yīng)北極極地氣候的關(guān)鍵所在。
    為了適應(yīng)北極的嚴(yán)寒,北極熊明顯偏向獵取脂肪含量高的獵物,但它卻沒(méi)有像人類罹患由于高脂肪攝入而產(chǎn)生的一系列心血管相關(guān)疾病。研究人員推測(cè)這些基因很可能在這方面起著關(guān)鍵作用,這個(gè)發(fā)現(xiàn)或?qū)槿祟愵A(yù)防或者治療由于高脂肪攝入而引起的心血管疾病提供新的方向和思路。
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  • 這篇文章是群體遺傳學(xué)為背景進(jìn)行的分析,選取了79只北極熊和10只棕熊進(jìn)行了全基因組重測(cè)序,主要的貢獻(xiàn)是完整解讀了北極熊基因組,揭示了北極熊適應(yīng)北極極地氣候之謎。

    另外,通過(guò)對(duì)群體數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,研究人員推算出北極熊的群體大小在2~2.5萬(wàn)之間,且處于減少的狀態(tài)中。值得注意的是,它們的棲息地——北極浮冰也在同期時(shí)間不斷減少。當(dāng)北半球高緯度地區(qū)開(kāi)始變暖時(shí),北極熊的近親棕熊或者灰熊就更易的向北遷徙,這樣就增加了它們和北極熊之間發(fā)生交配的可能。

    比較基因組揭示出,幾十萬(wàn)年來(lái)自然選擇驅(qū)動(dòng)了與血液中脂肪運(yùn)輸和脂肪酸代謝相關(guān)的一些基因發(fā)生了重大的改變。經(jīng)受最強(qiáng)力選擇的基因之一就是APOB,在哺乳動(dòng)物中APOB編碼了稱作為“壞”膽固醇——低密度脂蛋白(LDL)中的主要蛋白。這一基因發(fā)生改變或突變反映了北極熊飲食中關(guān)鍵的脂肪特性,北極熊需要應(yīng)對(duì)血液中高水平的葡萄糖和甘油三酯,尤其是膽固醇,對(duì)于人類而言這是一種危險(xiǎn)的物質(zhì)。脂肪占據(jù)了北極熊一半體重。

    通過(guò)對(duì)基因組中編碼蛋白的相關(guān)基因進(jìn)行更深入的分析后,研究人員發(fā)現(xiàn)很多與脂肪酸代謝和心血管功能相關(guān)的基因在北極熊中已經(jīng)發(fā)生了適應(yīng)性的進(jìn)化,這可能是它之所以能夠適應(yīng)北極極地氣候的關(guān)鍵所在。

    發(fā)現(xiàn)北極熊在幾十萬(wàn)年的進(jìn)化過(guò)程中,自然選擇使很多與脂肪運(yùn)輸和脂肪酸代謝相關(guān)的基因發(fā)生了適應(yīng)性的變化。載脂蛋白B基因(APOB)是其中一個(gè)受到強(qiáng)烈正向選擇的基因,它在哺乳動(dòng)物中編碼低密度脂蛋白(LDL),這種蛋白攜帶的膽固醇被人們普遍稱為“壞膽固醇”。該基因的改變使北極熊即使攝入高脂肪,也不會(huì)引起高血糖和高血脂等問(wèn)題。

    原文:Cell, Liu et al.: "Population Genomics Reveal Recent Speciation And Rapid Evolutionary Adaptation In Polar Bears."
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  • 2021-11-19 12:27

    意義在于通過(guò)對(duì)北極熊基因組分析,科學(xué)家們完整解讀了北極熊基因組,揭示了北極熊適應(yīng)北極極地氣候之謎。
    北極熊是一種生活在北極地區(qū),處在食物鏈頂端的大型食肉動(dòng)物。全球氣候變暖使北極熊的棲息地不斷減少,這一物種面臨著巨大生存壓力。
    為了全面系統(tǒng)地研究北極熊極地氣候的適應(yīng)性,科學(xué)家們對(duì)一只來(lái)自歐洲北部的北極熊進(jìn)行高深度的測(cè)序以獲取它的全基因組圖譜,此外還從瑞典、芬蘭、美國(guó)阿拉斯加冰川公園、阿拉斯加海岸附近的島嶼等地區(qū)共選取了79只北極熊和10只棕熊進(jìn)行了全基因組重測(cè)序。
    研究人員通過(guò)對(duì)北極熊和棕熊進(jìn)行比較基因組分析后,發(fā)現(xiàn)北極熊實(shí)際上比之前人們所認(rèn)為的要更年輕,與它的近親棕熊的分化時(shí)間只有不到50萬(wàn)年。而此前的研究推測(cè)北極熊和棕熊的分化時(shí)間約在60萬(wàn)至500萬(wàn)年前。
    這個(gè)時(shí)間段從進(jìn)化的尺度上來(lái)說(shuō)是相當(dāng)短的,人類約在500萬(wàn)年前與其近親黑猩猩“分道揚(yáng)鑣”。文章作者之一Rasmus Nielsen教授認(rèn)為:“北極熊和棕熊的進(jìn)化距離只有人和黑猩猩之間的十分之一。為適應(yīng)北極當(dāng)?shù)丨h(huán)境,北極熊所擁有的獨(dú)特適應(yīng)性,必須要在非常短的時(shí)間內(nèi)進(jìn)化完成。”這些適應(yīng)性變化不僅包括皮毛由棕色變成白色,身體表面變得更加順滑,而且包括巨大的生理和代謝變化。
    **北極熊基因編碼為心血管疾病提供思路******
    通過(guò)對(duì)基因組中編碼蛋白的相關(guān)基因進(jìn)行更深入的分析后,研究人員發(fā)現(xiàn)很多與脂肪酸代謝和心血管功能相關(guān)的基因在北極熊中已經(jīng)發(fā)生了適應(yīng)性的進(jìn)化,這可能是它之所以能夠適應(yīng)北極極地氣候的關(guān)鍵所在。
    為了適應(yīng)北極的嚴(yán)寒,北極熊明顯偏向獵取脂肪含量高的獵物,但它卻沒(méi)有像人類罹患由于高脂肪攝入而產(chǎn)生的一系列心血管相關(guān)疾病。研究人員推測(cè)這些基因很可能在這方面起著關(guān)鍵作用,這個(gè)發(fā)現(xiàn)或?qū)槿祟愵A(yù)防或者治療由于高脂肪攝入而引起的心血管疾病提供新的方向和思路。
    這個(gè)研究的最新成果以封面故事形式發(fā)表在《細(xì)胞》(Cell)雜志上。
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