請前輩講解下”群體SNP檢測數(shù)據(jù)分析“

健康 未結(jié) 0 683
Yana-Chan
Yana-Chan 2021-08-28 11:56

本菜鳥是做技術(shù)支持的,我看文獻有關(guān)群體SNP檢測有新的算法來代替以前的"個體SNP分析后整合的方法"(何偉明. 基于重測序數(shù)據(jù)的群體 SNP 位點檢測及基因型判斷[D]. 華南理工大學(xué), 2013.),想了解下現(xiàn)在重測序群體進化、結(jié)構(gòu)、多樣性分析,運用新型算法的優(yōu)勢是什么?我個人覺得個體SNP分析后整合不是更能說明群體的遺傳結(jié)構(gòu)嗎(個體數(shù)量足夠)?
還有有一些GWAS的文章中(Morris G P, Ramu P, Deshpande S P, et al. Population genomic and genome-wide association studies of agroclimatic traits in sorghum[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2013, 110(2): 453-458.),運用混養(yǎng)策略,以相同的地點的不同個體做pool這樣后續(xù)分析是什么樣的思路?望前輩賜教!
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