很有可能取代PCR。
RPA主要依賴于三種酶:能結(jié)合單鏈核酸(寡核苷酸引物)的重組酶、單鏈DNA結(jié)合蛋白(SSB)和鏈置換DNA聚合酶。這三種酶的混合物在常溫下也有活性,最佳反應(yīng)溫度在37°C左右。重組酶與引物結(jié)合形成的蛋白-DNA復(fù)合物,能在雙鏈DNA中尋找同源序列。一旦引物定位了同源序列,就會發(fā)生鏈交換反應(yīng)形成并啟動DNA合成,對模板上的目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行指數(shù)式擴增。被替換的DNA鏈與SSB結(jié)合,防止進(jìn)一步替換。在這個體系中,由兩個相對的引物起始一個合成事件。整個過程進(jìn)行得非???,一般可在十分鐘之內(nèi)獲得可檢出水平的擴增產(chǎn)物。常規(guī)PCR必須經(jīng)過變性、退火、延伸三個步驟,而PCR儀本質(zhì)上就是一個控制溫度升降的設(shè)備。RPA反應(yīng)的最適溫度在37°C-42°C之間,無需變性,在常溫下即可進(jìn)行。這無疑能大大加快PCR的速度。此外,由于不需要溫控設(shè)備,RPA可以真正實現(xiàn)便攜式的快速核酸檢測。
RPA檢測的靈敏度很高,能夠?qū)⒑哿康暮怂幔ㄓ绕涫荄NA)模板擴增到可以檢出的水平,從單個模板分子得到大約1012擴增產(chǎn)物。而且RPA還用不著復(fù)雜的樣品處理,適用于無法提取核酸的實地檢測。
RPA既可以擴增DNA也可以擴增RNA,還省去了額外的cDNA合成步驟。你不僅可以對擴增產(chǎn)物進(jìn)行終點檢測,還可以對擴增過程進(jìn)行實時監(jiān)控,甚至可以通過試紙條(側(cè)流層析試紙條LFD)讀取結(jié)果。
目前,TwistAmp?試劑盒的擴增子長度在500bp以內(nèi)。不過,經(jīng)過特別優(yōu)化的RPA擴增,也可以生成更長的擴增產(chǎn)物,或者減慢擴增速度(便于定量),甚至在更低的溫度下進(jìn)行反應(yīng)。