從犯罪現(xiàn)場收集來的各種DNA證據(jù)（血液，頭發(fā)，精液等等大家都熟悉了）為的是能夠從中提取足夠多的DNA。根據(jù)能獲得的DNA的量不同，可能會采取不同的分析方法。建立DNA-Profile的基礎就是分析高度可變的重復序列，這種是在染色體上頻繁出現(xiàn)的“可變數(shù)目的重復序列 (VNTRs)[1] “，或者是”短重復序列 (STRs) [2] ”（算是VNTPs的一種），這些序列在不同人的身上以不同長度的組合出現(xiàn)，近親間會非常相似，但在無親緣關(guān)系的人之間幾乎不可能會相同。這就是鑒定的理論基礎。
過程就是提取細胞核DNA，通過聚合酶鏈式反應 (PCR)[3] 對STR部位的片段進行指數(shù)級的擴增，因為之后的電泳會將這些片段按大小分離開來，所以總量必須夠大以保證分離之后得到的片段被檢測到。電泳的原理 @米叔 已經(jīng)講了，記得在幾年前一個講座里聽過現(xiàn)在鑒證科用的都是以毛細管電泳[4]為基礎的儀器，就是可以在很細的導管里用高壓使片段分子迅速分離，而且包括加螢光染料最后檢測對比的過程都可以實現(xiàn)自動化。分離之后，通過同時比對多個STR位點，就會給出一個條帶圖譜，以及這樣的圖譜在整個種群中出現(xiàn)的幾率，然后從統(tǒng)計學上給出一個帶有相同圖譜的人出現(xiàn)的可能性?；旧先绻麑Ρ?到15個這樣的位點，這個幾率就是幾百萬分之一。也就是說兩個沒有親緣關(guān)系的人幾乎不可能會有相同的STR圖譜。
然后每個國家對建立和比對這種DNA-Profile都有不同的程序，在德國就是將取證得來的未知的DNA-Profile與已有罪犯及嫌疑人的數(shù)據(jù)庫對比，不過結(jié)果本身似乎也不能作為是否有罪的直接證據(jù)。
另外也有其它方法來對DNA證據(jù)進行分析，比方使用線粒體DNA。線粒體DNA簡單來說就是一套除了我們通常所說的23對染色體基因組之外，存在于我們每個細胞的細胞器當中的獨立的DNA。它的特點的拷貝數(shù)量大，所以在不能獲得足夠生物組織樣本的情況下可以使用。據(jù)說世貿(mào)大樓災難里面的很多受難者都是通過這個方法確認身份的。
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