鳳凰網(wǎng)科技訊12月14日消息，深勢(shì)科技公布了其RiDymo?平臺(tái)管線應(yīng)用進(jìn)展，RiDymo?平臺(tái)是基于Reinforced dynamics （RiD）算法開(kāi)發(fā)的專注于解決“難成藥”靶點(diǎn)的動(dòng)力學(xué)平臺(tái)。
蛋白質(zhì)動(dòng)力學(xué)研究日趨成為全球藥物研發(fā)的熱點(diǎn)領(lǐng)域。通常的理性藥物設(shè)計(jì)需要靶標(biāo)蛋白具有明確的結(jié)構(gòu)和清晰的作用位點(diǎn)，這種類型的靶點(diǎn)通常稱為“可成藥”靶點(diǎn)，在人類靶點(diǎn)中占15%左右。其余85%為“難成藥”靶點(diǎn)，一般體現(xiàn)在蛋白表面平坦無(wú)清晰作用位點(diǎn)，或者蛋白結(jié)構(gòu)柔性大，甚至沒(méi)有穩(wěn)定的三維結(jié)構(gòu)。
此前，作為平臺(tái)核心能力的RiD算法已經(jīng)在Nature子刊上發(fā)表。在文章中顯示，針對(duì)一個(gè)蛋白的從頭折疊問(wèn)題，RiD方法模擬1.86μs時(shí)間獲得的自由能面比傳統(tǒng)分子動(dòng)力學(xué)方法100μs獲得的自由能面更加全面，展現(xiàn)出RiD方法在分子模擬的效率上有了近百倍的提升。
